虽然“双轨制”并没有随着时间推移完全消失，但许崇任表示，元培学院是建立在生源多样化基础上的一种有益于本科教育改良的模式。元培的改革，针对高等教育的两大突出问题：学生过早进入专业学习导致知识面偏窄；大多数学生盲目选择专业，学习后出现落差。
“北大就是要将相同的学生培养成不同的人。”许崇任称，元培为学生们提供了更多的选择机会，它不一定适合所有学生，但有其存在的必要性。”
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