因此，朱翊钧在通盘考虑了潘季驯的第三方案后，觉得这次黄故道的修复，很可能是改变中华民族常年水患的一次千载难逢的机会！
再说，张居正不敢想的事情，朱翊钧作为穿越者，还不敢想一想？
万历二年年底，潘季驯结束了全国各流域的考察，到京师述职。在朱翊钧主导下，秉承着边施工边完善方案的原则，在万历三年先进行准备工程。
因此，这第三方案一直秘而不宣，万历三年全国干的的热火朝天的，其实是第二、第三方案都要干的初期工程和农田水利基础工程。
直到河漕改海时潘季驯被攻击时，朝廷才公布出来一部分，主要是加高、加宽高家堰工程——尚不足第三方案总工程量的十分之一。
即便如此，也把集火潘季驯的反海运派压制到无语。
本时空的万历三年年底，随着河漕改海在朝野上下达成共识，加上黄河在今年的再次大泛滥，终于让本时空的朝廷痛定思痛。朱翊钧先说服内阁，后又推动朝廷通过了第三方案，拟第一期即投入一千二百万两白银，并陆续追加到总金额三千万两，以二十年为期，完成全部以新黄河入海通道为核心的全流域治水工程！