之后的一段时间里，尼奥接受了一系列的治疗，去修复他这具几十年都没动过的身体。
期间，他醒了一次，难受道：“为什么我的眼睛这么痛？”
墨菲斯一脸怜悯，“因为你从未睁开过双眼。”
这话一出，不禁墨菲斯自己的脸色黯然下去，连观众们都是一脸沉重。
对啊，泡在营养仓里，意识接入虚拟世界，这还需要睁开双眼吗？这还用得着眼睛这个器官吗？还用得着睁着眼去看虚拟世界吗？
这么多年的生活竟然都是假的，自己所见到的，所接触到的一切都只是一串串的代码数据而已。
真正的身体，却是泡在一个小小的营养仓中，夜以继日地泡着，泡了足足有几十年。直到如今，才被人从中解救出来。
这究竟是有多么的可悲啊。
虽然楚门生活的世界是虚伪的，但至少是一个活生生的世界啊，至少特么的不是一串数据就能解释的啊。
相比之下，尼奥更加的不幸。
.........
治疗结束后，尼奥醒了过来。墨菲斯带着他参观了他的飞船，为他介绍了船上的七八个船员。
这其中，就包括安妮。当然，韩夏也在其中扮演了一个性感漂亮的女船员，其余的，黄种人，白人，黑人，都有。
老大，自然就是周润发扮演的墨菲斯。
参观结束后，墨菲斯带着尼奥再次进入了矩阵这个虚拟世界，不过不是之前尼奥生活的世界，而是他们另外制作的程序。
用比喻来说，就好像矩阵是一个巨大的平台，这个程序就是附着于之上的一个app，之前尼奥生活的世界就是矩阵的官方app。
“这里，是主架构，是我们的载入程序。”墨菲斯和尼奥站在一片空白之中，墨菲斯正在向尼奥解释，“我们可以载入任何东西，衣物，设备，武器，拟真训练，不管什么东西，应有尽有。”
“你现在的形象叫做自我形象残留.....”
“什么是真？如果你指的是可被感知到，被嗅到，被尝到，被看到，那所谓真实无非就是经过你大脑处理过的电信号。”
墨菲斯继续为尼奥介绍他之前生活的世界，“这个世界尚处在二十一世纪初，是神经交互模拟id系统的一部分。我们称为矩阵，你之前是在梦里生活，尼奥。”
“这个世界，才是真实世界！”说着，墨菲斯带着尼奥来到模拟的真实世界中。