肾藏精主骨生髓，对人的寿命有重要影响。足少阴经为本藏的主管经脉，并通过本经分别与足太阳经、膀胱，手少阴经、心直接联系。在病理上，还分别与足太阴经、足厥阴经、督脉、冲脉等有某些特定的联系途径。
如：肾虚常选用阴谷、太溪、复溜调之；肾为寒湿瘀阻常用肾俞、次髎、委中等穴治之。
膀胱在六腑中亦属于一个特殊的腑，《素问·灵兰秘典论》曰：“膀胱者，州都之官，津液藏焉，气化则能出矣。”
此处要注意经文中的“津液藏焉，气化则能出矣。”这几个字，说明膀胱经对人体津液、体液的运行和代谢有重要调节作用，膀胱借助肾阳、命门之火与三焦腑共同对人体的津液布化、排出发挥决定性的调节作用。
（6）心包与三焦
《素问·灵兰秘典》曰：“膻中者，臣使之官，喜乐出焉。”心包亦称膻中，此处强调了心包的位置。意为心包是附属于心的一个脏，它执行心的一些功能，对人的情志舒缓、紧张有重要影响。
手厥阴经为本藏的主管经脉，并通过本经分别与手少阳经、三焦，足厥阴经、肝有直接联系。在病理上，还分别与手少阴经、手太阴经、阴维脉等有某些特定的联系途径。
如：心包郁热，常用曲泽、大陵、劳宫治之；手足厥阴经郁、瘀时常用大陵、行间治之。
三焦腑也是一个更为特殊的大腑，历代文献对其都有研究论述，争辩不已。《素问·灵兰秘典论》记载：“三焦者，决渎之官，水道出焉。”意为三焦是人体最广泛的体液流通网络通道系统。
以上讨论了脏腑经络不可分割的关系，从中已经显示出手足十二经、奇经八脉对脏腑生理、病理、诊断、治疗的重要价值。除此外，表里经、同名经、生克经的理论更具临床意义，在此简略讨论如下。
一是表里经。凡表里经连接的脏和腑，体内位置上都有明显的临近性：肝和胆皆在右胁下；心与小肠皆在横膈上下；脾胃均在腹部；肾与膀胱皆在腰部、盆腔中；肺与大肠在胸部，部分大肠在腹部（关于大肠的称谓和位置另文讨论）；心包与三焦主全身气血的运行和布化，功能上不能分离。
表里经所联系的脏与腑大多在营血供应、代谢排出方面具有共用或并行的结构。因此，在诊断治疗上，表里经理论都具有重要指导意义。针灸临床上选经配穴理论中“阴病取阳、阳病取阴、阴阳经并取”的治则就是据此建立的。
二是同名经。同名经是根据阴阳理论结合脏腑的生理、病理总结归纳出来的；概括了手足两经连接延续的特点，从而显示出所归属的两脏或两腑在生理、病理、诊断、治疗上的密切关系。针灸临床中，大量的同名经配穴组合就是据此理论建立的。
三是相生相克经。根据脏腑五行属性，在一定条件下，经络依其所属脏腑也能产生“有益”或“制约”的治疗作用，五输穴及其选经配穴就是据此理论建立的。后世建立的子午流注针法、灵龟八法等也与此有关，只是后者突出了时间对脏腑、对疾病、对治疗的决定性作用，这里不做讨论。