杰克船长通过航海图，破解了迷团，返回现实世界。
他们上岛寻找淡水时，发现了大章鱼海怪的尸体。原来对贝克特威胁最大的就是大章鱼海怪，所以他要杀死大章鱼海怪。
铁匠威尔出卖杰克船长，杰克船长被啸风抓住。原来，铁匠威尔要夺取黑珍珠号去救父亲。在海上，只有黑珍珠号才能和飞翔的荷兰人号匹敌。
杰克船长被啸风绑给贝克特，贝克特想要通过杰克船长消灭海盗王。因为巴博萨反抗，杰克船长逃回黑珍珠号。
现在没人再能制服贝克特以及飞翔的荷兰人号。
巴博萨说只有召集九大海盗王，召开海盗大会，解除被封印在凡人体内的海之女神卡利普索。利用卡利普索，就可以对付飞翔的荷兰人号和戴维·琼斯。
狡猾的巴博萨假装暗示伊丽莎白就是封印卡利普索的凡人，啸风将伊丽莎白带走，还想和伊丽莎白成亲。
结果亲完伊丽莎白，啸风就被炮弹击中身亡。临死前，他把船长的位置传给伊丽莎白，让伊丽莎白成为九大海盗王之一。
伊丽莎白被抓到飞翔的荷兰人号上，上面的人是曾经喜欢她的诺灵顿。伊丽莎白质问诺灵顿，是谁杀了他父亲，诺灵顿说他并不知道伊丽莎白父亲已死。
被关起来的伊丽莎白找到铁匠威尔的父亲比尔。比尔告诉伊丽莎白不要让威尔来救他。因为杀死戴维的人，必须永久代替戴维行使飞翔的荷兰人号船长之职。
也就是说，谁是飞翔的荷兰人号船长，谁就要替海之女神卡利普索摆渡亡灵，且十年才能上一次岸。
这等于是失去了自由。
当影片来到杰克船长对铁匠威尔哈一口气，把铁匠威尔熏晕摔下船时，观众们开心地笑了。
不愧为邋遢的杰克船长，连嘴巴的气都这么臭，能把人熏晕。
飞翔的荷兰人号上，还爱着伊丽莎白的诺灵顿放了伊丽莎白。临走他亲了伊丽莎白，因为掩护伊丽莎白逃走，诺灵顿被铁匠威尔的父亲比尔杀死。
沉船湾里，九大海盗王聚会，大家一起交出信物九枚银币。
结果，没有人拿出银币，都是把随手不起眼也不值钱的小物件拿出来。而巴博萨的信物，竟然为难是他手下的假眼珠子
这下，可把观众们逗乐了。
而巴博萨说出了海盗法典，观众们惊呼居然还真有什么海盗法典，吴龙的想法太奈斯了。
而保管海盗法典的人，竟然是杰克船长的父亲蒂格·斯派洛！
观众们都没想到，杰克船长还有父亲。通常来说，这种海盗船长、海盗王，不是应该父母双亡的吗？