达延汗在后藏跟吉雪巴等叛军作战，结果出了许多惊人意外，先是达延汗与甘丹颇章联军大败吉雪巴的叛军联军，可随便就发生了宁玛萨迦等花、红教半夜反戈的事，和硕特按兵不动见死不救，索南饶丹大败。
然后吉雪巴居然跟达延汗一起在江孜堡下会面，然后在明使的调停下，一起前往日喀则扎什伦布寺拜见四世上师，请这位八十多岁的大法会首座出面主持了两人的正式会盟。
大明使者、四世首座共同出面，达延汗与吉雪第巴握手言和，实际上整个和谈早在来日喀则之前就已经达成，都是由大明一手居中主持的，主要的条件都是大明划定的。
达延汗驻后藏日喀则，吉雪巴驻前藏喇萨，前后藏分治，且同时政教分离。
江孜堡则由卫藏衙门的卫藏将军带明军驻防，居中维和。
在日喀则的会盟后，才通知了喇萨那边，实际上就是生米煮成了熟饭，真的只是通知他们而已。
大首座亲至喇萨，五世也得给面子，金圣叹也是邀请了达延、吉雪第巴，还有花、红、白几教，还有工布那边的第巴叛军，甚至还有拉达克、锡金、布鲁克巴等诸藩一起会盟。
皇帝使者宣读皇帝的诏书，卫藏格局大变。
五世虽不满，可他的大总管索南饶丹在江孜死的不明不白，说是遇袭死于乱军中，但五世得到消息说其实索南饶丹那晚没死，是后来被达延软禁，因为索南饶丹不肯同意前后藏的分治，然后被达延汗秘密交给了吉雪第巴处死了。
达延汗与吉雪第巴一起谋杀了索南饶丹。
失去了这位得力的代理人，五世也方寸大乱。
最终在各方的咄咄逼迫之下，也只得奉旨同意。
金圣叹已经私下跟他谈过，说青海汗达赉非常尊崇他，要在青海湖边建一座格鲁大寺，然后请他前去驻锡。
当年五世还年少时，吉雪巴家族被藏巴汗击败赶去青海安多后，就曾跟却图汗谋划着要把五世强请去青海，索南饶丹带着五世赶紧跑到山南躲藏了许久。
他非常清楚，一旦离开卫藏，那就是鱼离开了水，以后就完全受制于人了。
在大明的多管齐下威逼利诱之下，没了左膀右臂索南饶丹这样强力助手的五世，最终也只能妥协。
不仅奉行大明皇帝圣旨，同时也承认前后藏的分治，让吉雪第巴接任第二任甘丹颇章第巴，也由他接管了甘丹颇章，前藏各宗的民政税赋等由他管理，各宗本等地方官员，由他提名然后经卫藏衙门转呈朝廷，由皇帝审核批准。
连格鲁派班两大系，也前后藏彻底分家，后藏的格鲁派寺庙、僧侣、庄园、僧兵，以及寺属的属民、农奴全都交给班系。班系在前藏的寺、僧、庄园、农奴等也交给达赉系。
但明显前藏亏大了。
甘丹赤巴这名义上的黄教教宗，也不再直接由达赉选任，而是两人共同提名，然后经大明天子册授，五年一任。
皇帝有意提高这位名义教宗。