军机处是将以前的中书省以及明朝后期的内阁制度一分为三。皇权大大提升。
直到雍正时期，雍正为打压八旗贵族，建立军机处。
将八旗议政之权，转移到了军机处。
从此形成由军机处议政，六部执行，内阁起草，一套程序。
但雍正怕军机处演变成另一个内阁，变发明了密折制度。
其实密折制度，并不是人们所想象的告密或特务制度。
而是借密折这套官员上书，皇帝下令的体系来达到皇帝直接管理六部，以及地方事务。
以防再次发生像明朝一样皇帝只能借助内阁来管理政务。
密折就是将以前的明文变成暗文，由以前内阁起草下发，变成皇帝自己直接批示下令，不经过任何部门。
皇帝想将旨意或命令发给巡抚就是巡抚，发给县令就是县令。也没有什么内阁或军机处的不同意就是白板圣旨了的说法。
直接变成皇帝所批就是圣旨。
而密折附带的另一个作用就是，明文变暗文告密之事。
在清朝密折制度之前，地方或朝廷给皇帝上书，不分公私事，都要由中书省或内阁先看，没有私密性，并且如果事情不重大，内阁或中书省可先一步处理。
皇帝下达命令或圣旨，也是由中书省或内阁去起草执行，一样没有私密性。
而密折制度就是在于札子、奏章、题本之外，又重新设计了一套官员给皇帝上书，皇帝给官员下令的系统。
密折制度的可怕之处不在于偷偷摸摸的给谁一个匣子，然后谁就可以偷偷的打报告了。
密折制度真正的可怕之处在于，给所有合适的官员都有一份可以给皇帝上书并接受皇帝命令的制度。
从此大小官员不分公私事都可以用奏折给皇帝上书。
而这类奏折除皇帝之外任何人都不能看。
因为人人都可以给皇帝上书了，并且是密折形式。
其他官员也不知道同僚到底给皇上写的是什么，有可能是请安折子，有可能是报告自己贪污受贿的。