码头核查的海关工作人员核定出税额，开具税票，商人凭借税票到银行缴纳赋税，这些赋税直接转化为海关放在银行的存款。
每半年向藩库上缴一次关税，在银行产生的利息就成了我海关的小金库，用于海关的福利发放。
商人缴完税之后，拿着银行开具的凭证到海关衙门换取通行发票，若是商人在满剌加就地交易的话，还要再根据交易金额缴纳一笔交易税。
同样的商人需要在本地进行采购，也要缴纳交易税，同时还要缴纳出口关税。当然这些外国商人若是不愿意在满剌加交易，也可以带着货物到旧港、爪哇、琼州交易。
同时海关还规定，所有外国商船进入满剌加之后必须卸掉所有的武装，商船的安全由我郑氏海军负责。
这些西夷对此非常抗拒，他们觉得没有武装遇到海盗没有反抗的能力，对此我们的统一回复是任何商船都会由我海军军舰护航，若是遇到海盗袭击，出现损失，由我海关全额赔偿。”