《新世纪福音战士》的故事就是所有使徒都想和亚当融合，让所有生命都回归一体，谁融合谁做主。
人类自然也要融合，但人类也分好几派，都想以自己为主导。比如seele，比如碇源堂司令，他们都是希望自己作为融合的主导。
seele的想法是，控制渚薰，最后让渚薰来完成目标，因为渚薰是人类培养的使徒，会按照人类的想法完成目标。
碇源堂则培养了绫波丽，又把亚当胚胎和自己融合，希望绫波丽配合自己融合。
但最后不管是渚薰还是绫波丽，都选择了碇真嗣，只能说碇真嗣是人见人爱，花见花开。大家都愿意和碇真嗣融合。
或许是因为碇真嗣没有强烈的欲望，不会以自己的贪欲去融合，而是会为大家去融合。
seele和碇源堂都是为了自己，在他们的天才计划里，并没有考虑过别人。可谓是计划是天才制定的，而是蠢材执行的。
碇真嗣、渚薰、绫波丽都是执行者，他们选择碇真嗣也算有点道理，毕竟执行者全是问题少年，比较之下，碇真嗣真的会为别人考虑。
所以就有分歧，不管是人类，还是使徒，只要有自由的意志，就会有不同的选择。
在各种各样的选择的推动下，碇真嗣被动地成为了人类补完计划的主导者，但他自己根本不知道应该怎么做。
根据《新世纪福音战士》的设定，融合重启不是一次两次了，而是很多次，最后一次重启，碇真嗣创造了一个没有使徒力量的普通人的世界。
这也算是弱者道之用了。强者都有自己的目标、自己的计划。但碇真嗣是弱者，他一直随波逐流，但最后渚薰和绫波丽都选择了他，因为作为使徒，他们相信碇真嗣可以创造一个让人类和使徒都幸福的世界。
不过碇真嗣肯定不会一步到位，所以融合了很多次，重启了很多次。
碇真嗣也毁灭过人类，甚至只剩下他和明日香的时候，他还想掐死明日香。因为他根本不知道应该怎么做，只觉得很麻烦。这个时候他也选择灭世。
因为只要毁灭，一切就都可以解决。
叶磷石最后的选择和最初的碇真嗣差不多，也是要毁灭一切，把人类存在的痕迹彻底消除。
但经历了一次次的重启之后，碇真嗣选择了接受现实，接受人类的分歧，接受自由的诅咒，让大家都正常地生活，而不是毁灭人类。
当然计划是天才制定的，是蠢材执行的。叶磷石最后也没有完全毁灭人类，因为接受她保护的新生命一样有自由意志。在叶磷石自我销毁的时候，新生命救出了他，带着他乘坐月人的飞船去往了新的星球。
人类从历史中学会的教训就是人类从来不会吸取教训。哪怕地球上产生了一批又一批的新生命，却总是掉进自由的诅咒之中难以自拔，不吸取人类的教训，不停重蹈覆辙。
其实这些问题，庄子就已经考虑过，写过一个寓言故事，叫做‘蜗角之国’，就是说蜗牛触角上有两个渺小的国家，打得不可开交。
但在普通人看来，没人在意这些渺小生物的战争，他们的战争毫无意义。