说到死亡空间就不得不提到神印marker，神印无疑是《死亡空间》剧情的核心中的核心，也是系列故事的起源。
系列的所有的重大事件都与神印密切相关：统one教的诞生，尸变体necromorph的产生与感染，地球政府的阴谋等等。
神印在系列中至少有三个不同的版本：原初的黑色神印，逆向工程得到的红色神印，和死亡空间2中出现的12号神印。
接触神印的人会受到精神污染。一般人看到已死的亲人等幻象，精神趋于不稳定——实际是引导他们自杀或杀死其他人变成尸体。进而转化成尸变体，杀死更多人滚雪球（类似丧尸爆发）。
一些精神力极强的人可以免受精神污染，所有的神印中都包含着人类dna以及生物进化的高等文明信息。