在杨毅的心中，一般军队的军长应该为少将军衔。但鉴于南京禁卫军驻守首都的特殊地位，军衔不宜过低，因此杨毅将徐孚远的军衔定为了中将，其他各级军官也相应的提高了一级。
作为一个文武双全的儒将，徐孚远对这些新的编制和新的军衔，很快就理解了其中的便利之处。但是，因为古代战争动辄数万、甚至上十万人规模的原因，徐孚远对皇上制定的“三三制”编制原则存在一些疑问。
冷兵器时代的战争，讲究集群优势，谁的人马越多，越集中，越能发挥兵力优势，击败敌方。
明朝虽然出现了火器，有大炮，有鸟铳，但却只是作为战争的辅助，而且都集中在北京神机营里。徐孚远身处江南，对热－兵－器的威力并不了解，也不知道未来将是由热－兵－器来主导战争。
因此，徐孚远对“三三制”的编制原则提出了疑问：“皇上，按‘三三制’进行编制，部队规模是不是太小了？臣认为，按‘五五制’编制，比较合理，可以发挥军队集群优势进行作战。”
杨毅摇了摇头，问道：“我们先不讨论编制规模，先说说你对热－兵－器是怎么看的？”
徐孚远愣了愣，问道：“热－兵－器？臣久在江南，对热－兵－器尚未亲自接触过。只是看到过别的部队有三五门大炮，发射的是实心铁弹，作用不是很大，只能用来攻城，对摧毁敌军城墙有一点作用。然后就是有些部队有几百人的火枪兵，装备了一些火铳、鸟铳、抬枪什么的，射击慢、故障多。臣不看好热－兵－器在战争中的应用前景。”
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