但是，俺答汗清楚地知道，存在于蒙古民众中根深蒂固的正统观念，是横亘在面前的巨大思想障碍。按照传统，俺答汗只能做“藩屏“，可是按照现实，俺答汗是右翼三万户实际上的盟主，他对其父违制僭号最终被迫交出汗权的教训仍记忆犹新。
这是传统与现实的矛盾，俺答迫切需要新的解决途径。
此时，萨满教的“天赋汗权”与他的政治目的相悖，中原农耕社会传入的道教亦无法在蒙古扎根。
隆庆五年，素有“额齐格喇嘛”(即蒙古藏传佛教之父)之称的格鲁派高僧阿兴喇嘛与俺答汗的会晤，是藏传佛教第二次传入蒙古的前奏。
在这次历史性的会晤中，阿兴喇嘛援引历史，有意把俺答汗比作忽必烈汗的化身。阿兴喇嘛详细解释了佛教“三宝、六道、八戒”的具体含义，对佛教经典《甘珠尔》、《丹珠尔》作了简明介绍。
但那都不是关键，关键他是劝告俺答汗与格鲁派宗教领袖索南嘉措直接取得联系，俺答汗则欣然接受，并作出立即派人赴藏迎请索南嘉措的决定。而其实，当时格鲁派的处境也很糟糕，很需要有权威的统治者帮他们一把。
中间的那些事情不必多说，反正到了最后，索南嘉措正式宣布：俺答汗和他，分别为忽必烈和八思巴的化身。
这意味着什么？意味着格鲁派领袖决心依靠蒙古、振兴黄教，双方意图不谋而合。
到了正式见面，蒙藏僧俗统治者握手言欢，互赠尊号。索南嘉措活佛尊俺答汗为“转千金轮咱克喇瓦尔第彻辰汗”，这个尊号与忽必烈汗相同(意即睿智贤明的转轮王)。
俺答汗则尊索南嘉措活佛为“圣识一切瓦齐尔达(赖)喇嘛”(意即法海无边伟大的上师)。这便是蒙藏合璧的黄教僧侣最高称谓“达(赖)喇嘛”的由来。
索南嘉措活佛往上追称两世，自称三世达(赖)喇嘛。与萨满教“天命思想”、“天赋汗权”相对应，索南嘉措活佛宣布佛教“转世论”与“佛授转轮王权”于俺答汗。
也就是说，俺答汗是转轮王成吉思汗、忽必烈汗的转世，他的转世是佛的旨意。
于是，索南嘉措活佛以宗教形式，使俺答汗非嫡长的汗位继承合理合法化了。
俺答汗则效法忽必烈汗，实行政教两种制度平行的政策，颁布了推行黄教的法律《十善福经法》，从法律的角度确立了黄教的统治地位。
黄教把俺答汗同成吉思汗、忽必烈汗联系在一起，既保持了蒙古民众对成吉思汗的崇仰，又剔除了“天赋汗权”、“嫡长继承”的传统观念，以完整的宗教理论为俺答汗争夺汗权开道铺路。
俺答汗则根据蒙古封建等级制度，规定了相应的黄教上层僧侣享有的与蒙古贵族同等的政治、经济待遇，并免征赋税。
从此以后，尊奉黄教、尊敬喇嘛，成为每个蒙古人的义务。
所以，黄教能够被俺答汗引入，就像昔年汉武帝独尊儒术一般，是统治者的需要。
不过麻烦在于，俺答虽然把自己的位置稳定了，也使得右翼蒙古越发地独立在“大元”之外，但他仍然没能完全脱离蒙元朝廷，还是不得不把长孙扯力克派往左翼蒙古的图们汗身边担任要职。
与此同时，让曹淦觉得不能不对高务实汇报的，是黄教在右翼蒙古发展之快。
据他所说，黄教传入右翼蒙古后，便排斥、打击、改造、融合蒙古传统宗教萨满教。比如在去年的察卜恰勒大会上，俺答汗就规定：禁止萨满教杀生祭祀，以黄教的诵经、敬佛、燃香等仪式代替萨满教的祭祀仪式；焚毁一切翁衮像，以黄教的智慧六手主像取代翁衮，供佛时只供三白，禁用血肉供养。