“责令非法居住在澳门地区的非大明户籍百姓在三日内离开澳门。现给出以下两个选择：其一，乘坐葡萄牙船只离开大明海域，回到欧罗巴或者其它非大明国土上定居；其二，乘坐大明战舰前往台岛，以外国移民的身份，接受当地安排，通过工作等方式获得外籍大明户口。
三日之后，南海舰队将对澳门非大明百姓进行武力驱逐，后果自负！”
西历1513年，葡萄牙船长豪尔赫·阿尔瓦雷斯抵达大明沿海，但直到20年后，葡萄牙的船只才获得明朝皇帝的许可，能够停泊在澳门附近的港口。
这个时候，葡萄牙商人和水手每晚必须返回船只休息，因为他们无法在明朝土地上建造任何建筑物。
西历1552年，明朝授权葡萄牙人在现在名为南湾的地区为其贸易商品建造仓库。
嘉靖时期，在西历1557年，葡萄牙获准在澳门建立贸易结算，葡萄牙人开始居住澳门。
此时，澳门仍然属于大明，并没有赠与葡萄牙人。
万历初年，河道官员受贿，使葡萄牙人居住澳门的事情，朝廷知道后。开始对葡萄牙人征收地租，每年约五百两白银。
由此可见，当时的澳门并未被葡萄牙人占领，其性质属于租用。
经过近45年的艰难谈判，葡萄牙人终于在大明的南方建立了真正的立足点。
葡萄牙人刚开始在澳门居住，只是在南湾沿海一带。
天启二年，大明朝廷进一步明确其居住范围。即从东望洋山顶灯塔西侧起，经水坑尾大炮台、白鸽巢、大三巴、营地大街、通天街、红窗门，直至西环竹仔室海滨。
万历四十二年，因为葡萄牙人勾结曾杀害官兵的倭人，当时的两广总督张鸣冈以此为理由，建言朝廷对居住在澳门的葡萄牙人进行有效的管理，遂被朝廷采纳。
香山知县蔡善，制定“治澳十则”，将葡萄牙人编户保甲，施行连坐，让其相互监督举报。
明朝时期的澳门其统治权和司法权，自始至终都掌握在朝廷手中。
在澳门居住的葡萄牙人违法犯罪是，由他们自己的官员负责抓捕审讯，然后移交大明官府进行处置。有罪行严重的罪犯会被带到广州明正典刑。
但是，之前的大明闭关锁国，对欧罗巴各国的政治文化缺乏了解。
并且，朝廷缺乏对侨民的管理认知，就造成葡萄牙人在澳门，擅自设立行政管理机构时，明朝无动于衷，并无任何反应。
这无疑会使葡萄牙人滋生更大的野心。
事实上，葡萄牙人一直致力于建设自己的政府组织。
早在明万历十一年，西历1583年的时候，澳门葡萄牙主教贾尼路就召集澳门葡萄牙人开会，选举6人，于翌年成立市政议会。