海军的主要基础来源于萨摩，而陆军主要基础来自于长州。
海陆军的矛盾直接原因，来自于两个藩的矛盾
其中萨摩势力海军，就如清朝一样，向英国看齐。
而陆军的学习对象则是大陆国家法兰西，在普法战争后又转向胜利的德意志。
日本工业化以来资源一直是处于缺乏状态，而从明治维新一直到二战，两个藩背后的势力在争夺工业资源——铁、煤、油，时所积累的矛盾也是从未消除。
两军之间的争斗，首先在个人层面上极为突出地体现了出来。
海军舰队总司令山本五十六，曾经有一次当着一位喋喋不休的陆军将军之面，推开椅子拂袖而去，以此表示对陆军的蔑视。
但这些都还算不了什么，只是小儿科。
陆海军之间不合所带来的毁灭性打击遍及各个领域，包括战略性供应的征集和部署、军备设计和生产以及成品的分配。
从制度上讲，陆军和海军的后勤供应都是由通产省掌管和分配的。
通产省和一个内阁计划委员会共同负责制定经济政策。
但是，海军和陆军都拒绝向行政部门，提供任何关于它们战略物资的处理数据，它们之间更是绝对相互保密。
这样一来，任何实际的计划都难以实施。
在从被占领的荷属东印度开采石油的问题上，双方的争斗更是到了荒唐的程度。
海军由于拥有大量的船舶，对石油的需求极为迫切。
而陆军由于步兵占了绝大部分，石油主要用于航空兵和坦克车辆等，所需有限。
但实际情况是，陆军早已垄断了日本的石油资源。
这种不平衡来自于一种奇怪的安排方式：被占领地区的石油资源的分割情况，是由最先占领该地区的军种决定的。
在这点上，陆军占有明显的优势。
它掌握着荷属东印度群岛最主要的油田，还握有6座大型的炼油厂。
这使得陆军拥有了前荷兰属地中85%的石油资源。